事实上，40年来，不断有读者和学者向红楼梦研究所、红楼梦学会以及人民文学出版社古典文学编辑部提出意见与建议。1994年和2007年，校注组专家又对新校本《红楼梦》进行了两次全面修订，并分别于1996年和2008年出版第二版、第三版。2008年，根据最新红学研究成果，新校本《红楼梦》的署名由过去的“曹雪芹、高鹗著”，改为了“（前八十回）曹雪芹著，（后四十回）无名氏续，程伟元、高鹗整理”。

　　“新校本《红楼梦》发行量大，不少读者发现问题就会提出来，有的学者还专门就校注问题写成论文发表。这些意见和建议反馈给了校注组专家以及红研所的老师们，我们出版社也曾收到读者的反馈。”谈及修订意见的收集，胡文骏这样说。

　　第三版序言里讲述了读者来信指出校勘错误的往事。第47回中，柳湘莲对贾宝玉说：“眼前十月一，我已经打点下上坟的花消。”校注组一开始将“十月一”改为“十月初一”。读者在信中说，“十月一”是北方为已故亲人送寒衣的民俗节日，不能改做“十月初一”。冯其庸他们请教了周围的老北京人和北方的朋友，都说至今仍有“十月一，送寒衣”的民俗，因此在第三版出版时，恢复了庚辰本底本的“十月一”。

　　在出版40周年来临之际，原校注组专家和中国红楼梦学会、红楼梦研究所相关专家以及人民文学出版社古典文学编辑部一起，再次对新校本《红楼梦》进行全面梳理修订。

　　“我们这次仍然是把各方面的意见收集起来，大家在一起一条一条地讨论，看法比较一致的就直接通过，不一致的就会更慎重些，有的意见就留到将来有新的研究成果出来再解决。”张庆善说。

　　此次修订过程中，校注组老专家胡文彬去世。孙伟科回忆，早在2020年12月份，他就收到胡文彬发给他的几百条意见，“一开始胡老师还参加了我们的讨论，遗憾的是，他在2021年5月去世了。在最后的时间里，胡老师都一直牵挂着这件事。”

　　老专家们强烈的责任心给孙伟科留下深刻印象，“你能感觉到，如果作品中间存在任何一个小的差错，都会让他们寝食难安。”

　　事实上，40多年过去，与吕启祥一起工作过的大多数专家都已去世。在出版40周年纪念会上，吕启祥说，继续修订是对这份事业的传承和延续，也是对他们的告慰和最好的纪念。

　　“吕启祥老师说自己年纪大了，看着周围的同道一个个离开，很着急，特别希望赶紧修订，把这份事业继续下去。”胡文骏说。

　　据统计，此次修订共订正正文及标点150余条，校记30余条，注释200余条。“每次修订的原则都是一样的，那就是忠实于曹雪芹原著，忠实于底本，吸收新的可靠的研究成果，改正错误。”张庆善说。

　　他介绍说，此次修订一个重要改动，是第63回芳官唱《赏花时》，第二句“闲为仙人扫落花”，之前校注组根据汤显祖原著《邯郸记》，将其校正为“闲踏天门扫落花”。但根据最新红学研究成果，“闲为仙人扫落花”来自雪芹祖父曹寅致友人的诗注，“这句曲子表达了曹雪芹对家族的怀念，他应该是有意这么写的，因此此次修订改回了底本原文。”张庆善说。

　　还有第76回中的名句“寒塘渡鹤影，冷月葬花魂”，这句话后半句曾校订为“冷月葬诗魂”，此次修订又改了回来。张庆善解释说，在庚辰本底本中，这里是“葬死魂”，旁边有墨笔改为“诗魂”，因此曾校订为“冷月葬诗魂”。但其实“葬死魂”的“死”，很可能就是“葬花魂”的“花”。林黛玉的诗也多次提到“花魂”，比如“昨宵庭外悲歌发，知是花魂与鸟魂。花魂鸟魂总难留，鸟自无言花自羞”，“偷来梨蕊三分白，借得梅花一缕魂”。另外，从格律上讲，“花”与前一句“寒塘渡鹤影”中的“鹤”也更对得上。“总之，是‘葬花魂’还是‘葬诗魂’，不是好和坏的问题，而是对和错的问题。”张庆善告诉记者。

　　这次修订中讨论得最多的，其实是一个很小的细节。《红楼梦》第28回中，大家说起为林黛玉配药，贾宝玉对王夫人说：“太太给我三百六十两银子，我替妹妹配一料丸药，包管一料不完就好了。”王夫人道：“放屁！什么药就这么贵？”于是，贾宝玉开始解释他要配些什么药，之前的版本是“头胎紫河车，人形带叶参，三百六十两不足龟，大何首乌，千年松根，茯苓胆……”，但“三百六十两不足龟”这里，大家总觉得读不通。“360两是清楚的，贾宝玉让他妈妈掏360两银子，可是‘360两不足龟’又是什么呢？”张庆善说，经过多次讨论，大家认为这里一方面是标点错了，一方面是批语误入正文，也就是说“三百六十两不足”应该是抄本的抄写者把脂评抄到了正文里，“当然，这只是我们的分析，并没有版本依据，为了尊重原著，就将这句话改为了‘头胎紫河车，人形带叶参——三百六十两不足——龟大何首乌，千年松根茯苓胆……’，这样一下子就全通了。”在此基础上，再通过注释解释为什么这样修订，“读者读到这里的时候，也可以参与思考讨论。”