主要是由脱氧腺苷酸(dAMP)、脱氧鸟苷酸(dGMP)、脱氧胞苷酸(dCMP)及脱氧胸苷酸(dTMP)四种脱氧核苷酸以3′，5′-磷酸二酯键连接形成的多核苷酸链(图1)。DNA的分子量很大，一般为106～1010。有些DNA分子中含有少量碱基被甲基化的脱氧核苷酸，这些碱基称修饰碱基，如5-甲基胞嘧啶等。在DNA多核苷酸链中每个磷酸的一个羟基与前一个核苷的C-3′羟基以酯键相连，另一个羟基与后一个核苷的C-5′羟基以酯键相连， 此酯键称3′，5′-磷酸二酯键。在多核苷酸链的一个末端核苷酸中糖的C-5′羟基连接一个磷酸基，具有极性，称5′-磷酸末端或5′-端。另一末端核苷酸中糖的C-3′为自由羟基，称3′-羟基末端或3′-端 ......