染色体上基因位置的改变导致表型效应改变的现象。基因在染色体上都有其特定的座位，一旦基因易位，将对基因的复制转录以及酶活性产生影响，最终反映表型变化。研究位置效应的方法是找出基因座位与生理功能的对应关系(见基因定位)。

1925年美国遗传学家斯特蒂文 (A. H.Sturte-vant)根据黑腹果蝇棒眼突变型的研究结果，提出了位置效应概念。1950年美国科学家刘易斯(E. B. Lew-is)把位置效应分为稳定型和花斑型两大类型。

果蝇的棒眼位置效应是较稳定的一种。在纯合的棒眼果蝇的后代中常发现少数野生型个体和少数超棒眼个体，这是由于x染色体上棒眼座位(B)相邻的基因(16A区段)不对等交换所致(见图) ......