等位基因间互相作用产生的效应，亦即基因型值(G)与其加性效应值(D)的差。又叫显性离差，以H表示，即H=G-D(设上位性效应I=0)。其值可为正数或负数，大小取决于群体中的基因频率，并是各位点内显性值的总和。

从遗传平衡群体的某一位点的一对等位基因出发，分别给基因型AA、Aa、aa指定基因型值d、h和-d，从基因型值减去育种值就可以求出显性值。但由于育种值是用距群体平均数(M)的离差表示的，所以基因型值也得先变换成离均差。估算AA的显性效应的步骤是：①基因型值减群体平均值，即d-M=d-〔d(p-q)+2pqh〕 =2qd-ph+2pqh〕 =2q(d-ph);②再从其中减去A基因的育种值2q 〔d+h(q-p)〕(见加性效应)得2q(d-ph)-2q〔d+h(q ......