世界已报道约70种，至1991年中国有近40种。重要病害有环斑病毒病和炭疽病和白粉病。

环斑病毒病 番木瓜最主要的毁灭性病害，1929年在牙买加首次报道为花叶病。1945年鉴定为番木瓜环斑病毒，中国1932年最初报道为花叶病，1964年被鉴定为番木瓜环斑病毒。1962年后在中国大陆主产区流行，台湾省1978年始报道，后严重爆发。症状为新叶呈黄绿相间的花叶，顶叶变小，严重花叶或皱缩黄化(见彩图);病树上部的嫩茎、叶柄和青果上产生大量水渍状条纹、环纹、环斑或同心圈斑，冬春期间病树叶片大多脱落，只顶部有黄色、质脆或皱缩的小叶。病原物为番木瓜环斑病毒(Papaya ringspot virus，PRV)，粒体线状700～80 ......