天然水中含量最多的是钙、镁、钠、钾、碳酸根、重碳酸根、硫酸根、氯根等八种离子，水质测定中用矿化度、总硬度、总碱度、硫酸盐、氯化物的含量来表征。这些离子含量多少与当地地质、地貌、气候和人为影响等因素密切相关。

水质随地质、地貌分区而变的宏观分布概况是：元江以东的滇东、滇东北及滇西北的澜沧江以东地区，石灰岩分布广泛，岩溶地貌发育充分，几乎包括了所有的岩溶地貌形态，地下河流分布广泛，溶于水中的碳酸盐多，所以这些地区地表水中的矿化度、总硬度、总碱度都比较高。滇南及滇西南地区如开远、文山以南，思茅、西双版纳及临沧地区，气候温和、雨量充沛， ......