重庆市农业科学研究所，是1958年由原西南农业科学研究所撤并后留下的部分人员组建起来的。

所内职能机构有： 党委办公室、行政办公室、人事科、总务科、财务科、科技管理科、蔬菜研究室、作物研究室、植保研究室、土肥研究室、农产品加工研究室、微生物研究室、情报资料研究室。下辖5个经济实体：农场、中外合资重庆科光种苗有限公司、食用菌种站、小磨麻油厂、重庆市渔用颗粒饲料厂。共有职工200余人，其中具有高级职称的13人、中级职称25人、初级职称62人。

建所以来，该所共取得部级科技成果3项，省级科技成果22项，市级科技成果26项 ......