1978年， 中共十一届三中全会和全国科学大会召开。在邓小平同志“科学技术是第一生产力”和“知识分子是工人阶级的一部分”的思想指引下，福建农业科研机构得到全面加强，农业科研进入一个新的发展阶段。

1.农业。1978年，福建省农科院将土壤肥料、耕作轮作、植物保护等3个研究室扩大为研究所。1979年3月，把科技情报处改建为科技情报研究所。1980年5月成立地热农业利用研究所。1983年3月，福建省农科院与农牧渔业部合办福建省农科院红萍研究中心。福建省农业科学院现辖稻麦、果树、茶叶、甘蔗、土壤肥料、植物保护、地热农业利用、畜牧兽医、科技情报等10个研究所和中心实验室、红萍 ......