据新疆水文和地质等有关部门测算，新疆源自降水的山丘区地下水天然补给量396亿立方米，其中325亿立方米在河流出山口前以基流汇入河道，或以山泉溢出地表，成为地表水资源组成部分，只有71亿立方米的基岩裂隙水及河床潜流成为平原区地下水的补给源。平原地下水补给量为395亿立方米，其中山区侧渗补给71亿立方米，平原降水入渗14亿立方米，合计85亿立方米为天然补给量;其余310亿立方米，占平原区补给量的78%，系由暴雨洪流补给12亿立方米，河道、渠系、水库及田间入渗补给298亿立方米，均为转化补给量。

全疆地下水资源量是山区和平原地下水补给量之和，减去两者的重复量，为572亿立方米 ......