经过多年建设，自治区逐步建立健全了粮油、饲料、种子、纤维、农副产品等质量监督监测体系，加强统一计划检查和日常监督检验。

为了保证新疆棉花的质量，除认真贯彻国务院及有关部委的规定外，自治区人民政府结合实际发布了《新疆棉花质量监督处罚暂行规定》、《新疆棉花轧花厂加工许可证发放管理办法》，自治区标准局又会同有关部门研究制定了《新疆锯齿机加工品级升级资格审查暂行规定》和《新疆棉籽加工升级管理办法》，加强对棉花的监督检查。1994年全区监督检验棉花8.68万吨，复验仲裁0.48万吨，质量公正检验0.33万吨，查出经济差额197.37万元。查封有质量问题的棉花0.74万吨， ......