新疆开办高等农业教育的时间较晚。民国23—25年(1934—1936年)，新疆省政府为培养农牧业技术人才，每年选派维吾尔、汉、哈萨克、柯尔克孜等民族知识青年100人，到原苏联塔什干国立大学和萨玛尔罕、安集延、阿拉木图等农业专科学校，学习农牧业技术和管理知识。其中知名的有赛福鼎·艾则孜、扎克洛夫、冯兆昆、司马义·牙生诺夫等。民国28年(1939年)，设立新疆高等农业学校，民国30年(1941年)并入新疆学院，设农艺、畜牧、兽医、水利4系。民国35年(1946年)，选派50名高中、初中学生赴国立西北农学院及所属高级农业职工学校就学深造。

新中国成立后，先后建立了新疆八一农学院、塔里木农垦大学 ......