两个性状育种值之间的相关，有时也指基因型值之间的相关。遗传分析中往往要区分性状间相关的遗传原因和环境原因。相关的遗传原因主要是基因的多效性，有时，连锁也能导致遗传相关， 但不稳定。如果同一环境差异对两个性状有同向或异向影响， 则会产生环境相关。

与表型方差分剖的情况相似， 两个性状间的表型协方差也可作相应分剖。X和Y两个性状的表型值可分别表示为：

Px=Gx+Ex

Py=Gy+Ey

COVpxy=COVGxy+COVExy