按一定生产程序。利用成套设备和技术控制调节环境条件以满足食用菌生长需要，周年生产食用菌的部门。食用菌工厂分为菌种工厂和食用菇类工厂两类。

菌种工厂 基本设施有隔热培养房、高压蒸汽灭菌锅、无菌冷却室、无菌接种室、无菌接种机、拌料机、装瓶或装袋机、麦粒筛选机和麦粒浸泡设备、麦粒蒸煮锅、加温、降温设备、通风控制系统等。菌种生产工艺(以蘑菇菌种生产为例)：①培养料制备。将谷粒(小麦、大麦、黑麦、谷子等均可)筛选去杂，置水中浸泡12小时，吸胀后煮10～15分钟(使之含水50%左右)，取出沥干，再均匀拌入2%石膏，装瓶(也可装入塑料袋)、塞紧棉塞，置1.5公斤/平方厘米蒸 ......