某些细菌发育的一个阶段在细胞内形成的休眠体。它不是繁殖器官，一个细胞只产生一个芽孢，一个芽孢也只萌发产生一个营养细胞。能形成芽孢的杆状细菌统属于芽孢杆菌科 (Bacilla-ceae)，分好气性的芽孢杆菌属(Bacillus)和厌气性的梭菌属(Clostri-dium)。个别的球菌和螺旋菌也能生成芽孢。

芽孢呈球形、卵圆形或短圆柱状，其大小有的等于或小于菌体直径，有的大于菌体直径。根据芽孢在菌体内的位置，分中央芽孢、偏端芽孢和顶端芽孢。大于电镜下的细菌芽孢(示多层次结构的厚壁)

菌体的芽孢在中央形成，菌体呈梭状，偏端形成呈汤匙状，顶端形成则呈鼓槌状。这些都是芽孢杆菌分类鉴定的重要特征 ......