上海食药用菌的自然种质资源贫乏，但中国微生物菌种保藏委员会农业微生物中心上海食用菌分中心设在市食用菌所，负责国内外食药用菌的收集与保藏，现保藏种有1千多株。经整理鉴定，出版的目录菌种有813株，61属。

1.食用菌。

(1)蘑菇。1925年，上海从法国引进菌种和栽培技术，是中国最早栽培蘑菇的地方。50年代，市农业试验站对蘑菇的制种技术和栽培工艺进行了研究，并获得成功，改变了每年必须从国外引进菌种的局面，并用猪牛粪代替马粪种蘑菇，向全国推广，为发展蘑菇生产开辟了新途径。引进和选育的蘑菇品系先后有101、102、102-1、176、U3、33、9506、173以及大肥菇、粽色蘑菇等数十个。

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